金蝶KIS 旗舰版配置的模块如下：
总账、报表、固定资产、现金管理、网上银行、实际成本、财务分析、应收款管理、应付款管理、人事管理、工资管理、采购管理、销售管理、仓存管理、存货核算，委外加工管理、生产数据管理、生产任务管理、物料需求计划、移动商务、BOS运行平台、BOS万能报表工具、BOS集成开发工具，金蝶KIS旗舰版公司，共计23个模块。
成本管理
提供产品实际生产成本核算功能，支持品种法、分步法、分批法、分类法等多种成本核算方法，可以与其它系统集成，快速自动采集产量、费用等数据，提供灵活的费用分配方法和向导式的成本计算、完备的成本计算报告。实现订单成本核算，金蝶KIS旗舰版，有利于评估订单利润及客户价值贡献率。实现完整的废品及联、副产品成本核算，并将各业务流程单据按凭证模板生成凭证传递到总账。多纬度的成本分析，为制定科学的经营决策提供强有力依据。
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